He re-encontrado este fantástico tutorial en Senócular sobre la clase Matrix. Es de AS2 pero sigue siendo exactamente igual en AS3.

http://www.senocular.com/flash/tutorials/transformmatrix/

Yo siempre me lio cuando quiero sesgar (skew) un clip de película, así que he escrito unas funciones muy simples para hacerlo más fácil:

import flash.geom.Matrix;

function setSkewX(mc:MovieClip, skewx:Number):void{
	var my_matrix = mc.transform.matrix;
	my_matrix.c = skewx;
	mc.transform.matrix = my_matrix;
}

function setSkewY(mc:MovieClip, skewy:Number):void{
	var my_matrix = mc.transform.matrix;
	my_matrix.b = skewy;
	mc.transform.matrix = my_matrix;
}

function getSkewX(mc:MovieClip):Number{
	return mc.transform.matrix.c;
}

function getSkewY(mc:MovieClip):Number{
	return mc.transform.matrix.b;
}